标题
支原体细菌的比较分析模型使用CytoSEED插件代谢模型可视化
教师的导师(s)
马修·德容博士
文档类型
海报
事件日期
4-12-2013
文摘
我们创建了数字4种支原体细菌代谢模型使用模型种子管道。然后我们提炼这些模型基于可用实验数据中发现的4种不同文献来源。四个模型较为相似,但217反应存在于至少1 4模型而不是所有4。我们还创建了软件工具来自动化部分的模型优化过程以及帮助我们和其他科学家在可视化模型。我们Cytoscape CytoSEED插件,允许动态观察、操纵,分析代谢模型使用模型创建的种子。今年夏天扩展包括增加支持查看基因表达数据,快速同步模型的可视化的能力已经被修改,并且能够导入和通量平衡分析实验的结果显示。额外的软件工具建立到模型种子模型优化和分析使用基因表达数据。
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