标题

建模荧光可见,尤其是烦恼实验,利用马尔可夫链分析的分子动力学和量子力学模拟

文档类型

海报

出版日期

1-29-2013

出版来源

生物物理期刊

卷号

104年

问题数量

2

第一页

683年,一个

最后一页

683年,一个

出版商

细胞出版社

石头

0006 - 3495

评论

补充1

文摘

提出了一种新的方法来模拟荧光可见,尤其是那些有关散装和单分子fluorescence-detected共振能量转移(FRET)实验。在这种方法中,一个分子动力学(MD)模拟用于示例配置空间和量子力学(QM)计算用于评估电子供体和受体之间的耦合探针快照沿着轨迹。马尔可夫链方法用于样本产生的电子耦合轨迹允许任何所需的荧光可见的准确模拟,如担心效率直方图或时间分辨供体荧光衰变。马尔可夫链结果将与简单的直方图和平均计划的结果表明收益率的马尔可夫链是唯一现实的结果众所周知的例子如快速扩散的限制。这种计算方法的结合也可以避免一些陷阱等传统烦恼分析kappa-squared和理想的偶极子近似。因为仿真结果可以直接与实验可见相比,这种方法可能允许更多的细节来自比传统实验。

3037 - posb807

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