标题

生成和比较分析公司的代谢模式属Shewanella使用模型的种子

教师的导师(s)

亚伦博士最好,世界杯荷兰vs厄瓜多尔走地
马修·德容博士世界杯荷兰vs厄瓜多尔走地

文档类型

海报

出版日期

4-15-2011

文摘

属Shewanella由水生微生物分布全球。其功能包括呼吸和代谢多样性以及在极端环境中生存的能力。研究Shewanella多才多艺的新陈代谢可以提供洞察该物种的生物技术如生物修复和微生物燃料电池的能力。模型的种子(http://seed-viewer.theseed.org/models),一个基于网络的资源微生物基因组分析,用于生成公司为基因组测序Shewanella代谢模型。草案代谢模型s oneidensis策划,重点地区的新陈代谢尚未well-curated在以前的建模工作(如厌氧呼吸系统、脂多糖生物合成)。这项工作的目标是1)扩大覆盖面的代谢多样性数据库用于新陈代谢建模,2)的设计和完善人工管理软件工具来促进新陈代谢模型和3)生成一个完整的美国oneidensis代谢模型,该模型可用于计算工具和高通量的实验方法来推进我们的理解代谢策略和生理学Shewanella属。

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