Aaron Best博士在伊利诺伊大学香槟分校完成微生物学和微生世界杯荷兰vs厄瓜多尔走地物进化领域的研究生和博士后培训后，于2004年秋天开始在霍普学院工作。他的研究包括理解人类寄生虫的独特转录过程兰伯氏贾第虫该研究将大规模数据集整合到玛卡塔瓦流域的细菌和微生物生态代谢模型中。每个项目都依赖于使用DNA序列来指导问题和假设。他的教学方式包括与实验室研究项目中的学生一对一互动，为一年级和高年级学生提供基于课堂的研究实验室体验，以及微生物学和生物信息学领域的互动课程。

感兴趣的领域

• 微生物基因组学-比较基因组学、基因组尺度代谢建模、转录调控网络建模、缺失基因功能鉴定、基因组测序和不同生态系统的微生物生态学。
• 微生物进化-真核生物转录系统的比较分析兰伯氏贾第虫，微生物代谢和转录网络的进化。

以本科生为主的机构的方法

• 收敛Aaron的研究兴趣最好是使用从目标生化和分子研究到建模和解释当今生物科学中产生的大规模数据集的技术。技术和问题位于多个学科之间的接口。因此，他的工作在很大程度上是合作的，为手头的研究带来了多学科的视角和技能。在一个生物系的本科机构的背景下工作提供了丰富的机会来研究生物学的多个尺度的问题，并允许与大型研究机构进行富有成效的合作。
• 将研究与课程相结合-基于课程的研究体验(CREs)对研究项目和学生都是有益的。CREs经常提供有用的初步数据，并为在项目领域受过训练的学生提供招聘机会。CREs让更多的学生通过实际做科学来学习科学。Aaron的研究兴趣的许多主要领域已经在他所教授的课程中作为CREs实现了。

教育

• 2002-2004年，伊利诺伊大学香槟分校微生物进化博士后(Carl R. Woese博士，导师)
• 伊利诺伊大学香槟分校微生物学博士(加里·j·奥尔森博士，导师)，2001年
  论文:古生菌和早期分化真核生物的转录进化，兰伯氏贾第虫
• 伊利诺伊大学香槟分校微生物学硕士(加里·j·奥尔森博士，顾问)，1999年
• 1996年，密苏里州利伯蒂威廉·朱厄尔学院生物学学士(保罗·w·加布里尔森，博士，论文导师)
  论文:利用18S核糖体DNA分析红藻的系统发育关系

荣誉和奖励

• 2017年度流域利益相关者奖玛卡塔瓦地区协调委员会的玛卡塔瓦流域项目
• 霍普学院遗传学Harrison C.和Mary L. Visscher教授的首任教授世界杯荷兰vs厄瓜多尔走地
• 霍普学院托斯利研究学者世界杯荷兰vs厄瓜多尔走地
• 访问研究科学家，桑福德·伯纳姆医学研究所，加州拉霍亚
• 阿贡国家实验室客座教师研究项目
• 《自然》杂志客座副编辑微生物学前沿，主持这个研究课题。所有微生物生物的综合代谢和调控模型(课题提案获前沿编辑)，2014 -至今担任该课题的首席编辑
• Nature出版集团国际开放获取期刊编委会成员(微生物部)，科学报告, 2011年至今

选择资助

• 国家科学基金，资助号MCB-1716285，“协同研究:RUI:通过从转录组数据推断的基因活性状态建模来研究微生物代谢和调控多样性”，PI: Best A and DeJongh M, 2017年9月- 2020年8月，488,522美元
• 国家科学基金，资助号MCB-1616737，“RUI:非宿主相关埃希氏菌群体基因组嵌合的动力学”，PI:最佳A奖，2016年8月- 2019年7月，775,316美元
• Sawyer Products，“水资源中微生物种群和化学污染物的全球调查”，PI: Best A, Peterson J, Pikaart M和Peaslee G, 2016年7月- 2017年12月，314,000美元
• Herbert H.和Grace A. Dow基金会，“迎接持续的挑战:招募、保留和毕业密歇根STEM学生”，与C. Mader和G. Peaslee, 2014年12月- 2017年11月
• 国家科学基金，资助号MCB-1330734，与M. DeJongh合作，“合作研究:RUI:开发综合代谢调控模型(imrm)，用于研究测序微生物的代谢和调控多样性”，2013年10月- 2016年9月
• 国家自然科学基金，项目编号DBI-1229585，与李j .合作，“MRI:获取下一代测序平台以加强希望学院的本科生研究和教育”，2012年9月- 2015年8月世界杯荷兰vs厄瓜多尔走地
• 能源部，分包合同号2F-30041，“KBase:预测生物学和环境研究的集成知识库”，与M. DeJongh和N. Tintle合作，2011年10月- 2016年9月
• 国家科学基金，奖励号为bi -0850546，“扩展RAST服务器以支持蜂窝网络的重建和建模”，与M. DeJongh, N. Tintle, D. Rodionov和R. Overbeek, 2009年9月- 2012年8月
• 国家科学基金，资助号:MCB-0745100，“RUI:所有测序微生物基因组的自动代谢重建”，与M. DeJongh合作，2008年8月- 2012年7月

选定的出版物

• “美国能源部系统生物学知识库(KBase)”，与A.P. Arkin、R.L. Stevens、R.W. Cottingham、S. Maslov、C.S. Henry等人合作，自然生物技术在新闻
• ”细菌基因组代谢特征的鉴定与分析，与N. Bowerman, N. Tintle和M. DeJongh，生物计算2017，世界科学,2017年
• ”北京鸭发育过程中肠道菌群动态特征及管理体系的影响，“与A.L.波特、S.M.弗莱利和G.S.弗莱利，微生物学前沿7:2125 2017
• ”微生物基因活性状态分类的贝叶斯框架，与C. Disselkoen、B. Greco、K. Cook、K. Koch、R. Lerebours、C. Viss、J. Cape、E. Held、Y. Ashenafi、K. Fischer、A. Acosta、M. Cunningham、M. DeJongh和N. Tintle，微生物学前沿7:1191 2016
• ”与使用美国管理系统的针表水线相比，用水槽饲养北京鸭会增加水污染和死亡率，与A. Schenk, A.L. Porter, E. Alenciks, K. Frazier, S.M. Fraley等人，家禽科学95.4, 2016
• ”基于表达数据的成对基因相关性的可靠性注意事项，“与S.鲍尔斯、M.德琼和N.L.廷特尔，微生物学前沿2015
• ”细菌中鼠李糖分解代谢途径和调控的比较基因组学和功能分析，“与I.A. Rodionova, X. Li, V. Thiel, S. Stolyar, K. Stanton, J.F. Fredrickson, D.A. Bryant, A.L. Osterman和D.A. Rodionov，微生物学前沿4, 2013
• ”结合实验和基因组学证据推断金黄色葡萄球菌转录调节网络，“与检察官Ravcheev、N. Tintle、M. DeJongh、A.L. Osterman、P.S. Novichkov和检察官Rodionov，细菌学期刊193年,2011年
• ”基因组尺度代谢模型的高通量生成、优化和分析，与C.S.亨利、M.德宗、P.弗莱伯格、B.林塞和R.L.史蒂文斯，自然生物技术2010年,28日
• ”RAST服务器:使用子系统技术的快速注释、R.K.阿齐兹、D.巴特尔斯、M.德琼、T.迪斯、R.A.爱德华兹、K. Formsma、S. Gerdes、E.M.格拉斯、M.库巴尔、F.迈耶、G.J.奥尔森、R.奥尔森、A.L.奥斯特曼、R.A.奥弗比克、L.K.麦克尼尔、D.帕尔曼、T. Paczian、B. Parrello、G.D.普什、C. Reich、R.史蒂文斯、O.瓦西耶娃、V.冯斯坦、A.威尔克和O.扎格尼科，BMC基因组学2008年,9日
• ”早期分化的肠道寄生虫的基因组极简主义，兰伯氏贾第虫，与h·g·莫里森、A.G.麦克阿瑟、F.D.吉利、S.B.阿利、R.D.亚当、G.J.奥尔森、w.w.坎德、f·陈、M.J.奇普里亚诺、B.J.大卫斯、S.C.道森、H.G.埃尔门多夫、A.B.海尔、M.E.霍尔德、S.M.豪斯、U.U.金、e·拉塞克-内塞奎斯特、g·曼宁、a·尼加姆、j·e·尼克森、d·帕姆、N.E.帕萨马内克、a·普拉布、C.I.赖希、D.S.莱纳、j·萨缪尔森、S.G.斯沃德和M.L.索金，科学、317、2007

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